Lëndët:

• Bazat e Shkencës Bimore/ Bachelor I në Bioteknologji
• Kulturat Qelizore dhe Indore/ BSH II në Bioteknologji
• Kulturat Qelizore dhe Indore/ MSH I në 'Bioteknologji Molekulare dhe Industriale'
• Evolucioni dhe Ruajtja e Biodiversitetit/ MP në 'Bioteknologji Mjedisore'

Tekste mësimore

• Valbona Sota, Efigjeni Kongjika (2013). Kulturat bimore indore dhe qelizore. ISBN: 978-99956-10-59-3. Shtëpia botuese “Akademia e Shkencave”, Tiranë, 2013.
• Efigjeni Kongjika, Valbona Sota (2012). Praktika të kulturave bimore indore dhe qelizore. ISBN 978-99956-10-54-8. Shtëpia botuese “Akademia e Shkencave”, Tiranë, 2012.

Monografi

• Kongjika E., Sota V., Papakosta E., Ferraj B. (2016). Ruajtja e materialit të pastër. Bankat gjenetike in vitro. Metodat e shëndetësimit: termoterapia dhe kultura in vitro e meristemës. Kapitujt12 & 13 të Monografisë së ASH : “Prodhimi dhe çertifikimi i fidanëve të pemëve frutore, hardhisë, ullirit dhe agrumeve në Shqipëri dhe Kosovë".
• Kongjika E., V. Mata (Sota) me bashkëpunëtorë (2005). “Vlerësimi shkencor i disa bimëve aromatike mjekësore – Perspektiva e kultivimit të tyre”, fq. 34 - 45. ISBN: 99943-656-7-3. Botim i Institutit të Kërkimeve Biologjike, Akademia e Shkencave, Tiranë, 2005.

Artikuj shkencorë:

• Sota V., Kongjika E., Damiano C. 2017. Collezioni in vitro di alcune specie autoctone del genere Prunus in Albania, Acta Italus Hortus (in press).
• Çuko B., Sota V., Kongjika E. (2017). Stabilisation of in vitro rhizogenesis of two apple (Malus domestica L.) cultivars during micropropagation. Albanian j. Agric. Sci. ISSN 2218-2020, Open access, Special Edition. Pg. 257 – 262.
• Sota V., Çuko B., Kongjika E. (2017). Effect of salinity stress on in vitro propagation of different wheat cultivars (Triticum aestivum L.). Albanian j. Agric. Sci. Open access, Special Edition. ISSN 2218-2020, Pg. 59 – 65.
• Kongjika E., Sota V. (2017). New opportunities of plant biotechnology in Albania using nanomaterials. JNTS (Joumal of Natural and Technical Sciences). Special Edition, No. 43. XXII, 23-37.
• Grazhdani M., Sota V., Çuko B., Kongjika E. (2016). Micropropagation of some albanian cultivars of Malus domestica borkh.via direct organogenesis. JNTS (Journal of Natural and Technical Sciences), ISSN 2074 - 0867, 2016, Vol. XXI (1):a\ 77 – 88.
• Sota V., Kongjika E. (2014). Micropropagation of wheat (Triticum aestivum L.) using mature zygotic embryos as primary explants. International Journal of Ecosystems and Ecology Science (IJEES), ISSN: 2224-4980, Volume 4, Issue 4, August, 2014, (Serial Number 16), page 619-626.
• Bekim Gashi, Kasamedin Abdullai, Valbona Sota, Efigjeni Kongjika (2014): Micropropagation and in vitro conservation of the rare and threatened plants Ramonda serbica and Ramonda nathaliae. Physiology and Molecular Biology of Plants, Springer, (ISSN 0974-0430, DOI 10.1007/s12298-014-0261-3.
• Sota V., Kongjika E. (2014). Development of a successful protocol for in vitro propagation of Prunus webbii Vierh. Using different seedling explants. AJNTS (Albanian Journal of Natural and Technical Sciences), ISSN 2074 - 0867, 2014, Vol. XIX (1): 63 – 77.
• Sota V., Kongjika E. (2014). The effect of nutrient media in micropropagation and in vitro conservation of wild population of mahaleb cherry (Prunus mahaleb L.). J Microbiol Biotech Food Sci: 1338-5178, 3(6) 453 – 456.
• Sota V., Kongjika E. (2014). Slow growth in vitro conservation of Zizyphus jujuba Mill. Agriculture & Forestry, Vol. 60. Issue 1: 27 - 37, 2014, Podgorica. UDK 634.662. ISSN 1800-9492.
• Bacu A., Sota V., Kongjika E. (2013). Pomegranates of Albania, the molecular evaluation of their genetic diversity and possible in vitro propagation of best varieties. Agriculture & Forestry, Vol. 59. Issue 2: 157-165, 2013, Podgorica. UDC (UDK) 634.64(496.5). ISSN 1800-9492

Artikuj konference:

• Kongjika E., Sota V., Kojdheli M. (2014). Comparison of different development pathways of pomegranate (Punica granatum L.) plants during tissue culture. 2nd International Conference on applied Biotechnology (ICAB), Tirana, Albania, September 22, 2014. Book of proceedings. ISBN: 978-99943-0-367-0.
• Grazhdani M., Kongjika E., Sota V., Xhixha E. (2014). Avoidance of polyphenolic oxidation of explants of some albanian cultivars of Malus sp. during early micropropagation stages. 2nd International Conference on applied Biotechnology (ICAB), Tirana, Albania, September 22, 2014. Book of proceedings. ISBN: 978-99943-0-367-0.
• Sota V., Kongjika E. (2014). In vitro culture of mature zygotic pomegranate embryos (Punica granatum L.). 8th CMAPSEEC (Conference on Medicinal and Aromatic Plants of Southeast European Countries). May 19 – 22, 2014. Durrës, Albania. Proceedings of Conference, p. 345 – 353;
• Sota V., Kongjika E. (2014). Mid-term in vitro conservation of myrtle (Myrtus communis L.) – A valuable medicinal plant. 8th CMAPSEEC (Conference on Medicinal and Aromatic Plants of Southeast European Countries). May 19 – 22, 2014. Durrës, Albania. Proceedings of Conference, p. 353 – 362;
• Sota (Mata) V., Kongjika E. (2013). In vitro propagation of plantlets of wild pear (Pyrus pyraster L.) using shoot tips as primary explants. 3rd International Conference of Ecosystems (ICE). Tirana, Albania, May 31 – June 5, 2013. Proceeding Book: Essays on Ecosystem and Environmental Research. ISBN: 978-9928-4068-7-3. Pg. 425 – 430.

Fushat e interesit:

• Mikroshumim dhe konservim in vitro
• Shëndetësim dhe termoterapi in vitro
• Streset abiotikë dhe seleksionimi in vitro
• Metabolizmi primar dhe sekondar

Projekte:

• “Inventarizimi i virozave dhe shëndetësimi i materialit mbjellës të specieve frutore dhe vreshtave në Shqipëri dhe Kosovë”. Projekti realizuar nga bashkëpunimi i Seksioneve të dy Akademive (Seksioni i Shkencave Natyrore dhe Teknike, AShSh dhe Seksioni i Shkencave të Natyrës, AShAK për vitet 2009 – në vazhdim.
• Përdorimi i metodave të bioteknologjisë për vlerësimin e biodiversitetit dhe veçorive adaptive të disa kategorive bimore spontane dhe të kultivuara në shërbim të kërkimit të ushtruar në ciklin e dytë dhe të tretë të studimeve. Programi Për Kërkimin Shkencor, FSHN-2016.
• Përdorimi i metodave të bioteknologjisë molekulare për vlerësimin e biodiversitetit bimor brënda dhe ndërllojor, diagnostikimin e hershëm dhe shëndetësimin ndaj fitopatologjive, dhe inicimi i metodologjisë drejt studimeve të nivelit proteomics. Programi Për Kërkimin Shkencor, FSHN-2013.
• “Pasurimi i Laboratorit të Kulturave Qelizore dhe Indore, pranë Departamentit të Bioteknologjisë, FSHN, UT, në shërbim të mësimdhënies cilësore dhe kërkimit shkencor të avancuar”, propozuar si pjesë e Projektit “Cilësi dhe Barazi në Arsim “ për Institucionet Publike të Arsimit të Lartë për pajisje laboratoresh kërkimor e didaktike për vitin 2010.
• “CERATONIA – Projekt ekzekutiv dhe plani i menaxhimit të organizmit ndërqeveritar Mesdhetar për rishpërndarjen në hapësirën e Mesdheut të specieve endemike tokësore dhe ujore” (INTERREG IIIA, Aksi II – Misura 2.1 – Azione 3), (Universiteti i Barit dhe Lecces), 2006 – 2008.

• Që prej vitit 2017 anëtare e forumit “Akademia e të Rinjve” pranë Akademisë së Shkencave, vendim nr. 14, dt. 07.06.2017, me qëllim mbështetjen e sudiuesve të rinj.
• Trainim në laboratoret e virologjisë vegjetale të CNR – IVV, UOS Bari për përvetësimin e teknikave të shëndetësimit dhe të diagnostikimit molekular të viruseve dhe viroideve, teknika të aplikuara në materialin bimor të specieve frutore bërthamore